Алакөл ойпатының топырақ жамылғысы Қазақстан топырақ сұлбасы бойынша Балқаш-Алакөл провинциясының шөлді зонасына жатады. Алакөл қорығының топырақ жамылғысы сұртопырақ, шөлді қоңыр және шөлді сұр-қоңыр автоморфты топырақ жамылғысымен берілген. Сонымен қатар топырақ жамылғысында әр түрлі интразональді топырақ түрлері кездеседі. Олардың ішінде шалғын-қоңыр, шалғынды, батпақты-шалғынды, батпақты, сортан мен сортаңдар.