Қорық аумағы тарихи қалыптасқан сулы – батпақты кешен, ол өзінің тұрақты гидрологиялық режимімен және ерекше гидрофлорасымен және гидрофаунасымен сипатталады.
Қорықтың негізгі аумағының бірі болып Тентек өзенінің атырауы табылады, оның ауданы 295 км2, Сасықкөл көлінің оңтүстік жағалауында Тентек өзенімен құрылған. Сонымен қатар біздің шекарамыздан тыс Тарбағатай жоталарынан бастау алатын Еміл өзені бар. Қорық үшін аса маңызды 4 ірі көл орын алады, олар - Сасықкөл, Қошқаркөл, Алакөл және Жалаңашкөл. Бұл көлдер тектоникалық, ежелгі Алакөл ойпатының ең төменгі бөлігін алып жатыр. Алакөл көлдерінің негізгі ерекшелігі күшті жер асты және артезиан суларымен қоректенуінде.
