За пятилетний период исследования на территории Алакольского заповедника были выявлены два новых вида млекопитающих, ранее не встречавшихся на территории заповедника - заяц-русак и шакал. Обитание зайца - русака отмечено только на участке заповедника расположенном на территории Уржарского района области Абай (Северная береговая кромка оз. Сасыкколь и система озер Мынколь).
Впервые заяц - русак был отмечен в 2020 году и по итогам учетов и мониторинга в 2021 г. был включен в список млекопитающих заповедника. Появление данного вида обусловлено расширением территории заповедника, в ходе которого данный участок был присоединён к заповеднику в 2010 году. Хотя местные жители, проживающие в поселке Сагат утверждают, что данный вид встречался на данном участке и ранее, хотя и не каждый год. По результатам мониторинга последующих лет было выявлено, что заяц - русак обитает на территории заповедника не круглый год, а только в осенне - зимний период, спускаясь сюда с выпадением снега в предгорьях системы гор Тарбагатай. Хотя единичные особи обитают здесь постоянно.
Шакал на территории заповедника впервые был отмечен 10 ноября 2022 года в правобережье дельты реки Тентек недалеко от кордона Туйыксу. В последующем присутствие данного вида на территории заповедника стало регулярно отмечаться инспекторами службы охраны. Так, по словам инспектора В.Осикова в окрестностях кордона Байбала в левобережье дельты реки Тентек, 10 декабря 2023 года обитало не менее восьми шакалов. В феврале этого же года три особи данного вида постоянно отмечалось в тростниках недалеко от кордона Туйыксу. В январе 2024 года одна особь данного вида была встречена инспектором охраны А.Тиссеным при объезде участка Северная береговая кромка оз. Сасыкколь, неподалёку от урочища Жинишкесу.
Появление шакала на территории заповедника, на наш взгляд, произошло вследствие его расселения севернее от его привычного ареала, чему способствовало сокращение численности его естественного врага волка, численность которого в последние годы значительно сократилась.