Большой баклан - крупная птица (длина тела до 1 м, размах крыльев до 1,5 м, масса 2–2,5 кг). Оперение чёрное, клюв крючковатый, щеки светлые. У молодых птиц нижняя часть тела имеет тускло-белую окраску. Бакланы встречаются по всей территории Казахстана, однако в северных регионах их гнездование нестабильно и происходит редко. Они обитают на любых водоёмах, при условии наличия основного корма - рыбы. Это колониальная птица. Гнёзда устраивает разнообразно: на земле сооружает из тростника и ила столбик с углублением сверху, а также размещает их на сломанном тростнике, скалах и даже на деревьях. Часто образует совместные колонии с пеликанами, колпицами, цаплями и другими птицами. В колонии бакланы, особенно птенцы, легко взбираются на ветви деревьев, используя крылья, шею и хвост. В кладке обычно 3–5 яиц, которые родители насиживают около одного месяца. Птенцов кормят частично переваренной рыбой, которую родители приносят в зобе. Взрослые птицы иногда съедают до 2 кг рыбы в сутки. Вылетевшие из гнезда птенцы собираются в группы и перемещаются к водоёмам, богатым кормом. Бакланы прилетают в марте и улетают в октябре. Встречаются на всей территории заповедника. Основные места гнездования - остров Орта Аралтобе, система озёр Мынколь и дельта реки Тентек. По данным учёта 2025 года, на территории заповедника зарегистрировано 9808 особей.
